
Vertreten durch die amtierende Präsidentin/ den amitierenden Präsidenten können die in Art. 1 Abs.2 Nr. 3 Bayerischen Hochschulgesetzes genannten Hochschulen Mitglied des Vereins werden. Alle staatlichen Hochschulen für angewandte Wissenschaften – FH und nichtstaatlichen Hochschulen für angewandte Wissenschaften – FH in kirchlicher Trägerschaft sind Mitglieder von HSBayern.
Vorsitzender des Vereins ist Prof. Dr. Gunter Schweiger, Präsident der Hochschule Ingolstadt. 2011 wurde er von der Financial Times Deutschland zum "Hochschulmanager des Jahres 2011" gewählt. Sein Stellvertreter ist Prof. Dr. Michael Braun. Er leitet eine der größten Hochschulen für angewandte Wissenschaften in Deutschland: die Georg- Simon- Ohm Hochschule Nürnberg.
Die frühere Bayerische Präsidenten- und Rektorenkonferenz (PRK) wurde im Mai 2006 in den gemeinnützigen Verein HSBayern überführt. Die Gründungsversammlung fand an der Hochschule Würzburg-Schweinfurt statt. Gründungsvorsitzende war Frau Prof. Dr. Marion Schick, damalige Präsidentin der Hochschule München, dann Kultusministerin in Baden-Württemberg und ab 2012 Vorstandsmitglied der Deutschen Telekom. Stellvertretender Vorsitzender war ebenfalls bis Mai 2008 Prof. Dr. Reinhard Höpfl, Präsident der Hochschule Deggendorf.
Die Tätigkeit des Vereins ist nicht auf Gewinn gerichtet. Der Verein bezweckt die strategische Positionierung der Mitgliederhochschulen und fördert Wissenschaft, Forschung und Kunst in Bayern.
Die Finanzierung erfolgt über Mitgliederbeiträge.
HSBayern: